Гостро стояла в стосунках Росії і ДВР з Китаєм проблема Монголії. Російські інтереси в Монголії традиційно були значними. Міжнародний статус Монголії визначався Кяхтинским угодою між Росією і Китаєм від 7 червня 1915 р., яке забезпечувало Зовнішній Монголії у складі Китаю широку автономію. Росія визнавала сюзеренітет Китаю відносно Монголії, але будь-які питання політичного і територіального характеру, що зачіпають Росію, вважала за краще вирішувати на трибічній основі за участю монгольської сторони. Після краху Російської імперії співвідношення сил в Монголії порушилося. Номінально верховним владикою Монголії вважався глава її ламаїстської церкви богдо-гогэн.
Різке послаблення впливу Росії після жовтневого перевороту 1917 р. в Петрограді створило в Монголії деякий політичний вакуум, який спробував заповнити за підтримки Японії отаман Семенов. Після загибелі адмірала Колчака він оголосив себе його наступником на східних околицях Росії і, перейшовши в монгольські межі з російської території, створив там свою базу з претензією на формування власного "уряду".
Осінню 1919 р., коли Червона армія наблизилася до меж Монголії, Пекін спробував зміцнити свої позиції і ліквідовував монгольську автономію, позбавивши владу богдо-гогэна. У відповідь на це в 1920 м. Москва посилила свою політику в монгольському питанні і стала виступати за повну незалежність Монголії від Китаю. Хоча така політика завдавала збитку російсько-китайським стосункам, Москва вважала, що ліквідація впливу Семенова і Японії, що стоїть за ним, в Монголії компенсує цю напруженість.
Тим часом усередині Монголії відбувалися зміни. Що відколовся від отамана Семенова колишній командувач кінно-азіатською дивізією його формувань генерал-лейтенант барон Р. Ф.Унгерн фон Штенберг осінню 1920 р. зайняв Ургу (Улан-Батор) і переконав богдо-гогэна повторно проголосити себе правителем Монголії. Успішно вирішивши це завдання, Унгерн фактично очолив в 1921 р. монгольську виконавчу владу в якості військового диктатора. По його наполяганню Монголія проголосила свою повну незалежність. Не задовольняючись досягнутим, в тому ж році барон Унгерн зробив спробу військової експедиції на територію ДВР в Забайкаллі, але були розбитий Червоною армією. Після загибелі Унгерна склалися сприятливі умови для походу радянських формувань на Ургу. Разом з частинами Червоної армії в поході брали участь нечисленні місцеві монгольські революціонери з Монгольської народно-революційної партії, які фактично і захопили владу в країні після узяття її столиці і створили в липні 1921 р. так званий народний уряд. Новий режим формально не скасовував прерогатив богдо-гогэна, хоча останній як і раніше фактично не мав ніякої влади.
Дружнє відношення нового керівництва і монгольського населення до Червоної армії, а також пасивність китайського уряду в монгольському питанні дозволили радянським збройним силам безперешкодно залишатися в Монголії невизначено довго. Монголія фактично перетворилася на сферу впливу Радянської Росії. Такий стан справ був закріплений в липні 1921 р. офіційним проханням монгольського уряду не виводити частини Червоної армії з Монголії. Таким чином, в Монголії більшовики змогли повністю реалізувати установку Комінтерну на надання підтримки національно-революційному руху на Сході. Проте, юридично Радянська Росія продовжувала визнавати Монголію частиною Китаю і не встановлювала дипломатичних стосунків з МНР.